2007年全国共报告甲、乙类传染病发病3580477例，死亡12954人。报告发病率为272.39/10万，死亡率为0.99/10万,病死率为0.36%；较2006年分别上升了2.08%、21.31%和18.82%。全年除传染性非典型肺炎、脊髓灰质炎和白喉无发病、死亡报告外，其他病种均有报告。
2007年全国共报告丙类传染病发病1189383例，死亡83人。报告发病率为90.48/10万,死亡率为0.0063/10万；与2006年相比，报告发病率上升了5.64%，死亡率下降了20.25%。
与2006年相比,2007年甲乙类传染病中,呼吸道传染病和血源及性传播传染病报告发病率分别上升3.55%和6.96%。其中,呼吸道传染病中的猩红热和麻疹上升幅度较大, 病例数分别上升了20.61%和8.88%；血源及性传播传染病中的艾滋病、丙肝和梅毒上升幅度较大, 病例数分别上升了45.04%、30.01%和24.09%。自然疫源及虫媒传染病和肠道传染病报告发病数分别较2006年下降19.20%和9.19%。
2007年，全国共报鼠疫发病2例，死亡1人，报告发病数比2006年增加1例；共报霍乱发病164例，无死亡，报告发病率比2006年上升了2.46%。
2007年，全国共报告人感染高致病性禽流感病例4例(江苏2例、安徽和福建各1例),死亡2人,报告发病数比2006年减少8例。
2007年全国未发生大范围的传染病暴发流行，但部分传染病在局部地区发生流行或暴发，如8-10月广东和福建部分地区的登革热暴发疫情; 9-10月广东、云南、重庆等地的急性出血性结膜炎暴发疫情；四川凉山州、广东深圳和新疆西南部等地区的麻疹高发疫情；新疆和田和喀什地区的流脑高发疫情；辽宁沈阳市的风疹暴发疫情；贵州黔西南州、新疆喀什地区、甘肃天水等局部地区的甲肝暴发疫情等。
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