在发展中国家,下呼吸道感染通常为主要的死亡原因或仅次于腹泻.30岁以上的成人肺炎的最常见病因是细菌.其中肺炎链球菌最常见.其他病原菌包括厌氧菌,金黄色葡萄球菌,流感嗜血杆菌,肺炎衣原体,鹦鹉热衣原体,沙眼衣原体,卡他莫拉菌,嗜肺军团菌,克雷白肺炎杆菌和其他革兰氏阴性杆菌.肺炎支原体为一种类似细菌的微生物,是年龄较大儿童和青年特别常见的病因,常见于春季.婴儿和儿童的主要肺炎病原体是病毒：呼吸道合胞病毒,腺病毒,副流感病毒,甲型和乙型流感病毒.这些病原体也能引起成人肺炎；但对原先健康的成人来说,唯一可能严重且普遍的病毒是甲型流感病毒,偶尔还有水痘---带状疱疹病毒.其他病原体有：更高级的细菌,包括诺卡菌和放线菌；分枝杆菌,包括结核分枝杆菌和非典型菌株(主要为堪萨斯分枝杆菌和鸟型细胞内分枝杆菌)；真菌包括荚膜组织胞浆菌,粗球孢子菌,皮炎芽生菌,新型隐球菌,烟曲菌和有隔膜毛霉菌和卡氏肺囊虫；以及立克次体,主要为伯纳特氏柯克斯氏体(Q热).
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