1、细菌性肺炎 需氧革兰氏染色阳性球菌：如肺炎链球菌（肺炎球菌）、金黄色葡萄球菌、甲型溶血性链球菌等。
2、需氧革兰氏染色阴性球菌：如肺炎克雷白杆菌、流感嗜血杆菌、绿脓杆菌、肠杆菌属、大肠埃希菌、变形杆菌等。
3、厌氧杆菌：如棒状杆菌、梭状杆菌等。
4、病毒性肺炎 ：腺病毒、呼吸道合胞病毒、流感病毒、禽流感病毒、麻疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、副流感病毒、汉坦病毒肺综合征、冠状病毒、Hendra and Nipah病毒、Metapeumovirus病毒等。
5、支原体肺炎 ：肺炎支原体
6、衣原体肺炎 肺炎衣原体与鹦鹉热衣原体
7、真菌性肺炎 白色念珠菌、曲菌、放线菌等。
8、其他病原体所致肺炎 立克次体（如Q热立克次体）、弓形体（如鼠弓形体）、原虫（如卡氏肺孢子虫）、寄生虫（如肺包虫、肺吸虫、肺血吸虫）、军团菌等
